我国学者开发构建了精神分裂症的遗传数据库SZDB

科技日报 2017/3/24

近日,中国科学院昆明动物研究所罗雄剑课题组和姚永刚课题组开展合作,开发构建了精神分裂症的遗传数据库SZDB。

关于精神分裂症的研究有两个重要问题仍有待解决:第一,大量遗传学研究已鉴别出许多与精神分裂症显著相关的遗传变异,而这些遗传变异如何导致疾病易感目前仍不清楚。第二,除遗传研究外,人们还开展了大量其他方面的研究,并积累了众多相关数据,如差异基因表达数据、表观遗传数据、基因共表达数据等,如何从积累的这些海量数据中抽提出有意义的生物学信息仍然是一个挑战。

为了给上述问题提供一个可能的解决方案,同时也为研究者提供一个易于使用和查询的数据资源平台,罗雄剑课题组和姚永刚课题组合作开发构建了精神分裂症的遗传数据库SZDB。SZDB收集了众多与精神分裂症相关的数据,包括遗传研究数据(如来自于遗传连锁和关联研究、GWAS、外显子组测序、拷贝数变异、整合分析等的数据)、基因表达数据(包含差异表达和时空表达模式的数据)、网络数据(蛋白相互作用和共表达网络)、大脑eQTL数据以及SNP功能注释数据等。通过对这些不同层面的数据进行整合和分析,鉴别一些重要的精神分裂症候选基因。 (记者 马波)

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